fastqc Mac 版下载安装教程

fastqc 是什么

fastqc 是一款命令行工具：高通量测序数据的质量控制工具。

它以 Homebrew formula 形式分发，会构建或解包二进制文件并放进 PATH。它采用 GPL-3.0-or-later 许可证分发。

fastqc 当前版本 0.13.0，近 30 天在 Homebrew 上安装 84 次，以命令行工具形式提供，适合写进脚本或 CI 流程。

核心功能

功能与用途来自 Homebrew 元数据和项目说明，具体以官方文档为准。

• 高通量测序数据的质量控制工具。
• 适合在命令行中完成批量处理和自动化任务。
• 以命令行工具形式安装，可在终端中直接调用。

fastqc 适合谁用

• 习惯在命令行完成批量处理与自动化的用户
• 希望审计源码、或需要自行编译修改的用户
• 想尝试小众工具、不介意社区规模较小的用户
• 需要在终端中调用、便于写进脚本或 CI 流程

fastqc 不适合：完全依赖图形界面、不熟悉命令行的用户。

安装量与热度

最近 30 天通过 Homebrew 安装 84 次，过去 12 个月累计 1,364 次。

如何安装 fastqc

1. 打开 终端（按 ⌘ + 空格，输入“终端”）。
2. 如果还没安装 Homebrew，先运行下面这条安装命令。 $/bin/bash -c "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/HEAD/install.sh)"复制
3. 运行 brew install fastqc。 $brew install fastqc复制

和同类应用怎么选

fastqc 近 30 天安装 84 次，在命令行工具分类中排名第 3709。 当前版本 0.13.0 已发布为正式版。 项目开源，可以自行审计代码、提交 issue 或参与贡献。 需要逐项对比时，可参考下方的替代品与对比页。

与同类应用对比

只对比公开元数据，不做主观推荐；需要逐项对比时见对比页。

与同类应用对比

应用	版本	许可证	架构	近 30 天安装
fastqc	0.13.0	GPL-3.0-or-later	命令行	84
got	0.130	ISC	命令行	87
pyscn	1.33.0	MIT	命令行	87
xvid	1.3.7	GPL-2.0-or-later	命令行	94

命令行工具中的类似应用

同一分类中最接近的应用，按介绍相似度和安装量排序。它们是相关工具，并非确认可互换的替代品；人工挑选的正面对比请见对比页。

采用相同许可证的应用

• gnu-tar
• gsasl
• less
• cabextract
• weechat
• jpegoptim

所属分类：命令行工具